source: trunk/dports/science/ncbi_tools/Portfile

Last change on this file was 69604, checked in by jmr@…, 7 years ago

ncbi_tools: remove binaries which apparently are not being built from list used in destroot (#22916)

  • Property svn:eol-style set to native
  • Property svn:keywords set to Id
File size: 2.9 KB
Line 
1# $Id: Portfile 69604 2010-07-10 21:24:46Z ryandesign@macports.org $
2
3PortSystem 1.0
4
5name            ncbi_tools
6version         20080302
7description     blast is a set of tools for doing nucleotide and protein searches
8maintainers     gmail.com:mike.thon
9categories      science
10platforms       darwin
11homepage        http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/
12fetch.use_epsv  no
13master_sites    ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/toolbox/ncbi_tools/old/20080302
14distfiles       ncbi.tar.gz
15checksums       md5 f8de9d7264aed7de1d87d2185df2e07c
16dist_subdir     ${name}/${version}
17extract.mkdir   yes
18
19patchfiles      darwin.ncbi.mk.diff
20if {[string match *64* $build_arch]} {
21    patchfiles-append c-toolkit-no-carbon.patch
22}
23
24use_configure   no
25use_parallel_build no
26build.cmd       './ncbi/make/makedis.csh'
27build.target
28set binaries    "blastall         dosimple         gil2bin \
29asn2ff           blastall_old     entrcmd          idfetch          seedtop \
30asn2gb           blastcl3         impala           seqtest \
31asn2idx          blastclust       errhdr           indexpub         tbl2asn \
32asn2xml          blastpgp         fa2htgs          makemat          test_regexp \
33asndhuff         cdscan           fastacmd         makeset          testcore \
34asntool          checksub         findspl          megablast        testobj \
35bl2bag.cgi       copymat          formatdb         ncbisort         testval \
36bl2seq           formatrpsdb      nph-viewgif.cgi \
37blast            debruijn         gene2xml         vecscreen \
38demo_regexp      getmesh          wblast2.REAL \
39demo_regexp_grep getpub           rpsblast         wblast2_cs.REAL"
40
41set manpages    "Psequin.1       asnval.1        cleanasn.1      formatdb.1      insdseqget.1    tbl2asn.1 \
42asn2all.1       bl2seq.1        copymat.1       formatrpsdb.1   makemat.1       trna2sap.1 \
43asn2asn.1       blast.1         ddv.1           gbseqget.1      makeset.1       trna2tbl.1 \
44asn2ff.1        blastall.1      debruijn.1      gene2xml.1      megablast.1     udv.1 \
45asn2fsa.1       blastall_old.1  entrez2.1       getmesh.1       nps2gps.1       vecscreen.1 \
46asn2gb.1        blastcl3.1      errhdr.1        getpub.1        rpsblast.1 \
47asn2idx.1       blastclust.1    fa2htgs.1       gil2bin.1       sbtedit.1 \
48asn2xml.1       blastpgp.1      fastacmd.1      idfetch.1       seedtop.1 \
49asndhuff.1      cdscan.1        findspl.1       impala.1        sortbyquote.1 \
50asntool.1       checksub.1      fmerge.1        indexpub.1      spidey.1"
51
52destroot {
53    xinstall -m 755 -d  ${destroot}${prefix}/share/doc/${name}
54    file copy ${worksrcpath}/ncbi/doc ${destroot}${prefix}/share/doc/${name}
55    foreach binary ${binaries} {
56        xinstall -m 755 ${worksrcpath}/ncbi/bin/${binary} ${destroot}${prefix}/bin/
57    }
58    foreach manpage ${manpages} {
59        xinstall -m 444 ${worksrcpath}/ncbi/doc/man/${manpage} ${destroot}${prefix}/share/man/man1/
60    }
61}
62
63long_description    ${description}
64livecheck.type      regex
65livecheck.url       ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/toolbox/ncbi_tools/
66livecheck.regex     old/(\[0-9\]+)
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.