source: trunk/dports/science/ncbi_tools/Portfile @ 50984

Last change on this file since 50984 was 50984, checked in by and.damore@…, 10 years ago

Maintainer email change, second batch, mail without @macports.org domain are put in domain:user form.

  • Property svn:eol-style set to native
  • Property svn:keywords set to Id
File size: 2.9 KB
Line 
1# $Id: Portfile 50984 2009-05-14 21:08:43Z and.damore@macports.org $
2
3PortSystem 1.0
4
5name            ncbi_tools
6version         20080302
7description     blast is a set of tools for doing nucleotide and protein searches
8maintainers     gmail.com:mike.thon
9categories      science
10platforms       darwin
11homepage        http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/
12fetch.use_epsv  no
13master_sites    ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/toolbox/ncbi_tools/old/20080302
14distfiles       ncbi.tar.gz
15checksums       md5 f8de9d7264aed7de1d87d2185df2e07c
16dist_subdir     ${name}/${version}
17worksrcdir
18use_configure   no
19build.cmd       './ncbi/make/makedis.csh'
20build.target
21set binaries    "Psequin          blastall         dosimple         gil2bin          sbtedit \
22asn2ff           blastall_old     entrcmd          idfetch          seedtop \
23asn2gb           blastcl3         entrez2          impala           seqtest \
24asn2idx          blastclust       errhdr           indexpub         tbl2asn \
25asn2xml          blastpgp         fa2htgs          makemat          test_regexp \
26asndhuff         cdscan           fastacmd         makeset          testcore \
27asntool          checksub         findspl          megablast        testobj \
28bl2bag.cgi       copymat          formatdb         ncbisort         testval \
29bl2seq           ddv              formatrpsdb      nph-viewgif.cgi  udv \
30blast            debruijn         gene2xml         psiblast.REAL    vecscreen \
31blast.REAL       demo_regexp      getmesh          psiblast_cs.REAL wblast2.REAL \
32blast_cs.REAL    demo_regexp_grep getpub           rpsblast         wblast2_cs.REAL"
33
34set manpages    "Psequin.1       asnval.1        cleanasn.1      formatdb.1      insdseqget.1    tbl2asn.1 \
35asn2all.1       bl2seq.1        copymat.1       formatrpsdb.1   makemat.1       trna2sap.1 \
36asn2asn.1       blast.1         ddv.1           gbseqget.1      makeset.1       trna2tbl.1 \
37asn2ff.1        blastall.1      debruijn.1      gene2xml.1      megablast.1     udv.1 \
38asn2fsa.1       blastall_old.1  entrez2.1       getmesh.1       nps2gps.1       vecscreen.1 \
39asn2gb.1        blastcl3.1      errhdr.1        getpub.1        rpsblast.1 \
40asn2idx.1       blastclust.1    fa2htgs.1       gil2bin.1       sbtedit.1 \
41asn2xml.1       blastpgp.1      fastacmd.1      idfetch.1       seedtop.1 \
42asndhuff.1      cdscan.1        findspl.1       impala.1        sortbyquote.1 \
43asntool.1       checksub.1      fmerge.1        indexpub.1      spidey.1"
44
45destroot {
46    xinstall -m 755 -d  ${destroot}${prefix}/share/doc/${name}
47    file copy ${worksrcpath}/ncbi/doc ${destroot}${prefix}/share/doc/${name}
48    foreach binary ${binaries} {
49        xinstall -m 755 ${worksrcpath}/ncbi/bin/${binary} ${destroot}${prefix}/bin/
50    }
51    foreach manpage ${manpages} {
52        xinstall -m 444 ${worksrcpath}/ncbi/doc/man/${manpage} ${destroot}${prefix}/share/man/man1/
53    }
54}
55
56long_description    ${description}
57livecheck.check     regex
58livecheck.url       ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/toolbox/ncbi_tools/
59livecheck.regex     old/(\[0-9\]+)
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.