Changeset 33351


Ignore:
Timestamp:
Jan 24, 2008, 1:51:27 PM (11 years ago)
Author:
ryandesign@…
Message:

ncbi_tools: maintainer update to version 20070826; closes #14047 and #14028.

File:
1 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • trunk/dports/science/ncbi_tools/Portfile

    r33347 r33351  
    22PortSystem 1.0
    33name            ncbi_tools
    4 version         20061015
     4version         20070826
    55description     blast is a set of tools for doing nucleotide and protein searches
    66maintainers     michael.thon@yahoo.com
     
    1111master_sites    ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/toolbox/ncbi_tools/
    1212distfiles       ncbi.tar.gz
    13 checksums       md5 8eca84753fd7a1d39bab256a4944f65e
     13checksums       md5 c17f7b08c12823e4320661894110dcb1
     14dist_subdir     ${name}/${version}
    1415worksrcdir     
    1516use_configure   no
    1617build.cmd       './ncbi/make/makedis.csh'
    1718build.target
    18 set binaries   "Psequin asn2ff asn2gb asn2idx asn2xml asndhuff asntool bl2bag.cgi bl2seq blast blast.REAL blast_cs.REAL blastall blastcl3 blastclust blastpgp cdscan checksub copymat ddv debruijn demo_regexp demo_regexp_grep dosimple entrcmd entrez2 errhdr fa2htgs fastacmd findspl formatdb formatrpsdb getfeat getmesh getpub getseq gil2bin idfetch impala indexpub makemat makeset megablast ncbisort nph-viewgif.cgi psiblast.REAL psiblast_cs.REAL rpsblast seedtop seqtest tbl2asn test_regexp testcore testobj testval udv vecscreen wblast2.REAL wblast2_cs.REAL"
     19set binaries    "Psequin          blastclust       findspl          psiblast.REAL \
     20asn2ff           blastpgp         formatdb         psiblast_cs.REAL \
     21asn2gb           cdscan           formatrpsdb      rpsblast \
     22asn2idx          checksub         gene2xml         sbtedit \
     23asn2xml          copymat          getmesh          seedtop \
     24asndhuff         ddv              getpub           seqtest \
     25asntool          debruijn         gil2bin          tbl2asn \
     26bl2bag.cgi       demo_regexp      idfetch          test_regexp \
     27bl2seq           demo_regexp_grep impala           testcore \
     28blast            dosimple         indexpub         testobj \
     29blast.REAL       entrcmd          makemat          testval \
     30blast_cs.REAL    entrez2          makeset          udv \
     31blastall         errhdr           megablast        vecscreen \
     32blastall_old     fa2htgs          ncbisort         wblast2.REAL \
     33blastcl3         fastacmd         nph-viewgif.cgi  wblast2_cs.REAL"
    1934
    20 set manpages    "Nentrez.1 Psequin.1 asn2asn.1 asn2ff.1 asn2gb.1 asn2xml.1 asndhuff.1 asntool.1 bl2seq.1 blast.1 blastall.1 blastcl3.1 blastclust.1 blastpgp.1 cdscan.1 checksub.1 copymat.1 ddv.1 debruijn.1 entrcmd.1 entrez2.1 errhdr.1 fa2htgs.1 fastacmd.1 findspl.1 fmerge.1 formatdb.1 gbseqget.1 getfeat.1 getmesh.1 getpub.1 gil2bin.1 idfetch.1 impala.1 indexpub.1 makemat.1 makeset.1 megablast.1 netentcf.1 rpsblast.1 seedtop.1 tbl2asn.1 udv.1 vecscreen.1"
     35set manpages    " Nentrez.1       blastall_old.1  findspl.1       makeset.1 \
     36Psequin.1       blastcl3.1      fmerge.1        megablast.1 \
     37asn2all.1       blastclust.1    formatdb.1      netentcf.1 \
     38asn2asn.1       blastpgp.1      formatrpsdb.1   nps2gps.1 \
     39asn2ff.1        cdscan.1        gbseqget.1      rpsblast.1 \
     40asn2fsa.1       checksub.1      gene2xml.1      sbtedit.1 \
     41asn2gb.1        cleanasn.1      getfeat.1       seedtop.1 \
     42asn2idx.1       copymat.1       getmesh.1       sortbyquote.1 \
     43asn2xml.1       ddv.1           getpub.1        spidey.1 \
     44asndhuff.1      debruijn.1      gil2bin.1       tbl2asn.1 \
     45asntool.1       entrcmd.1       idfetch.1       trna2sap.1 \
     46asnval.1        entrez2.1       impala.1        trna2tbl.1 \
     47bl2seq.1        errhdr.1        indexpub.1      udv.1 \
     48blast.1         fa2htgs.1       insdseqget.1    vecscreen.1 \
     49blastall.1      fastacmd.1      makemat.1"
    2150
    2251
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.